O iate "São Tomé" foi construído no Arsenal da Marinha por João Ferreira da Silva. Em 16 de Setembro de 1859 foi lançado à água. Também aparece como palhabote. Deslocava 109 toneladas.e foi armado com 1 peça. Em 20 de Setembro de 1865 armou a escuna. A lotação em 1860, era de 30 homens.
O navio serviu na província de S. Tomé e Príncipe. Desempenhou comissão a Luanda, S. Tomé, Ambriz, Zaire, e ao sul de Angola. Cruzou na costa de Angola.
Nos últimos anos, passou a pontão-farol e foi, depois, entregue à Alfândega em 1869. Em 1870, ainda fazia parte dos navios da Armada. Parece ter sido desmanchada por inútil em 1870.